-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 3
/
v1.1_issues.bed
394 lines (394 loc) · 24.6 KB
/
v1.1_issues.bed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
chr1 2701 2729 Error_Kmer 100 . 2701 2729 0,0,0
chr1 855037 864660 Low_Qual 100 . 855037 864660 204,0,0
chr1 859421 859445 Error_Kmer 100 . 859421 859445 0,0,0
chr1 859534 859568 Error_Kmer 100 . 859534 859568 0,0,0
chr1 859616 859650 Error_Kmer 100 . 859616 859650 0,0,0
chr1 859698 859750 Error_Kmer 100 . 859698 859750 0,0,0
chr1 859999 860063 Error_Kmer 100 . 859999 860063 0,0,0
chr1 860865 860898 Error_Kmer 100 . 860865 860898 0,0,0
chr1 860900 860921 Error_Kmer 100 . 860900 860921 0,0,0
chr1 24541572 24546322 Low 100 . 24541572 24546322 204,0,0
chr1 31691015 31691044 Error_Kmer 100 . 31691015 31691044 0,0,0
chr1 40071105 40071134 Error_Kmer 100 . 40071105 40071134 0,0,0
chr1 98144438 98144468 Error_Kmer 100 . 98144438 98144468 0,0,0
chr1 137920152 137922046 Low 100 . 137920152 137922046 204,0,0
chr1 161788483 161788516 Error_Kmer 100 . 161788483 161788516 0,0,0
chr1 164288080 164288110 Error_Kmer 100 . 164288080 164288110 0,0,0
chr1 170807834 170807855 Error_Kmer 100 . 170807834 170807855 0,0,0
chr1 176297504 176297529 Error_Kmer 100 . 176297504 176297529 0,0,0
chr1 179589633 179589661 Error_Kmer 100 . 179589633 179589661 0,0,0
chr1 193561609 193561635 Error_Kmer 100 . 193561609 193561635 0,0,0
chr1 209666986 209667014 Error_Kmer 100 . 209666986 209667014 0,0,0
chr1 242937554 242937575 Error_Kmer 100 . 242937554 242937575 0,0,0
chr10 117 150 Error_Kmer 100 . 117 150 0,0,0
chr10 7461525 7461546 Error_Kmer 100 . 7461525 7461546 0,0,0
chr10 10289076 10289105 Error_Kmer 100 . 10289076 10289105 0,0,0
chr10 19474084 19474106 Error_Kmer 100 . 19474084 19474106 0,0,0
chr10 55292567 55292592 Error_Kmer 100 . 55292567 55292592 0,0,0
chr10 81323606 81323648 Error_Kmer 100 . 81323606 81323648 0,0,0
chr10 85916083 85916111 Error_Kmer 100 . 85916083 85916111 0,0,0
chr10 98128445 98135485 Low_Qual 100 . 98128445 98135485 204,0,0
chr10 98134230 98134252 Error_Kmer 100 . 98134230 98134252 0,0,0
chr10 98367079 98367107 Error_Kmer 100 . 98367079 98367107 0,0,0
chr10 112126892 112134338 Low_Qual 100 . 112126892 112134338 204,0,0
chr10 112128883 112128917 Error_Kmer 100 . 112128883 112128917 0,0,0
chr10 112129029 112129052 Error_Kmer 100 . 112129029 112129052 0,0,0
chr10 112129331 112129363 Error_Kmer 100 . 112129331 112129363 0,0,0
chr10 112129411 112129441 Error_Kmer 100 . 112129411 112129441 0,0,0
chr10 112129447 112129475 Error_Kmer 100 . 112129447 112129475 0,0,0
chr10 112132970 112132991 Error_Kmer 100 . 112132970 112132991 0,0,0
chr10 112133079 112133100 Error_Kmer 100 . 112133079 112133100 0,0,0
chr10 112133239 112133275 Error_Kmer 100 . 112133239 112133275 0,0,0
chr10 112133278 112133328 Error_Kmer 100 . 112133278 112133328 0,0,0
chr10 112133346 112133368 Error_Kmer 100 . 112133346 112133368 0,0,0
chr10 112133391 112133452 Error_Kmer 100 . 112133391 112133452 0,0,0
chr10 112133462 112133484 Error_Kmer 100 . 112133462 112133484 0,0,0
chr10 112133572 112133612 Error_Kmer 100 . 112133572 112133612 0,0,0
chr10 112133629 112133650 Error_Kmer 100 . 112133629 112133650 0,0,0
chr10 129374292 129374315 Error_Kmer 100 . 129374292 129374315 0,0,0
chr10 129375516 129375537 Error_Kmer 100 . 129375516 129375537 0,0,0
chr10 129375923 129375951 Error_Kmer 100 . 129375923 129375951 0,0,0
chr10 129376033 129376090 Error_Kmer 100 . 129376033 129376090 0,0,0
chr10 129377806 129377830 Error_Kmer 100 . 129377806 129377830 0,0,0
chr10 134669826 134694962 Low_Qual 100 . 134669826 134694962 204,0,0
chr10 134682009 134682037 Error_Kmer 100 . 134682009 134682037 0,0,0
chr10 134683590 134683628 Error_Kmer 100 . 134683590 134683628 0,0,0
chr10 134683713 134683735 Error_Kmer 100 . 134683713 134683735 0,0,0
chr10 134683785 134683812 Error_Kmer 100 . 134683785 134683812 0,0,0
chr10 134684013 134684051 Error_Kmer 100 . 134684013 134684051 0,0,0
chr10 134686269 134686298 Error_Kmer 100 . 134686269 134686298 0,0,0
chr10 134686954 134686983 Error_Kmer 100 . 134686954 134686983 0,0,0
chr10 134688035 134688061 Error_Kmer 100 . 134688035 134688061 0,0,0
chr10 134688939 134688978 Error_Kmer 100 . 134688939 134688978 0,0,0
chr10 134689618 134689658 Error_Kmer 100 . 134689618 134689658 0,0,0
chr11 94 126 Error_Kmer 100 . 94 126 0,0,0
chr11 7268973 7269002 Error_Kmer 100 . 7268973 7269002 0,0,0
chr11 8255224 8260765 Low_Qual 100 . 8255224 8260765 204,0,0
chr11 8257985 8258023 Error_Kmer 100 . 8257985 8258023 0,0,0
chr11 47701640 47701672 Error_Kmer 100 . 47701640 47701672 0,0,0
chr11 54243937 54285163 Low 100 . 54243937 54285163 204,0,0
chr11 54336552 54344715 Low_Qual 100 . 54336552 54344715 204,0,0
chr11 54337534 54337555 Error_Kmer 100 . 54337534 54337555 0,0,0
chr11 54341554 54341580 Error_Kmer 100 . 54341554 54341580 0,0,0
chr11 54342604 54342630 Error_Kmer 100 . 54342604 54342630 0,0,0
chr11 74007191 74007217 Error_Kmer 100 . 74007191 74007217 0,0,0
chr11 78637473 78637495 Error_Kmer 100 . 78637473 78637495 0,0,0
chr11 80089939 80089968 Error_Kmer 100 . 80089939 80089968 0,0,0
chr11 101940150 101940172 Error_Kmer 100 . 101940150 101940172 0,0,0
chr11 110054554 110054576 Error_Kmer 100 . 110054554 110054576 0,0,0
chr11 133873343 133875462 Low_Qual 100 . 133873343 133875462 204,0,0
chr11 133875360 133875383 Error_Kmer 100 . 133875360 133875383 0,0,0
chr11 133875395 133875423 Error_Kmer 100 . 133875395 133875423 0,0,0
chr12 41012694 41012724 Error_Kmer 100 . 41012694 41012724 0,0,0
chr12 63962538 63962562 Error_Kmer 100 . 63962538 63962562 0,0,0
chr12 66695014 66695044 Error_Kmer 100 . 66695014 66695044 0,0,0
chr12 73677149 73677175 Error_Kmer 100 . 73677149 73677175 0,0,0
chr12 84063422 84063450 Error_Kmer 100 . 84063422 84063450 0,0,0
chr12 86976028 86976060 Error_Kmer 100 . 86976028 86976060 0,0,0
chr12 126838753 126844426 Low_Qual 100 . 126838753 126844426 204,0,0
chr12 126839622 126839648 Error_Kmer 100 . 126839622 126839648 0,0,0
chr12 133004269 133015040 Low_Qual 100 . 133004269 133015040 204,0,0
chr12 133005255 133005296 Error_Kmer 100 . 133005255 133005296 0,0,0
chr12 133005313 133005334 Error_Kmer 100 . 133005313 133005334 0,0,0
chr12 133005512 133005550 Error_Kmer 100 . 133005512 133005550 0,0,0
chr12 133005568 133005589 Error_Kmer 100 . 133005568 133005589 0,0,0
chr12 133005640 133005668 Error_Kmer 100 . 133005640 133005668 0,0,0
chr12 133005831 133005852 Error_Kmer 100 . 133005831 133005852 0,0,0
chr12 133006205 133006233 Error_Kmer 100 . 133006205 133006233 0,0,0
chr12 133006561 133006582 Error_Kmer 100 . 133006561 133006582 0,0,0
chr12 133006603 133006626 Error_Kmer 100 . 133006603 133006626 0,0,0
chr12 133006965 133006995 Error_Kmer 100 . 133006965 133006995 0,0,0
chr12 133007192 133007213 Error_Kmer 100 . 133007192 133007213 0,0,0
chr12 133007345 133007366 Error_Kmer 100 . 133007345 133007366 0,0,0
chr12 133007470 133007510 Error_Kmer 100 . 133007470 133007510 0,0,0
chr12 133007532 133007553 Error_Kmer 100 . 133007532 133007553 0,0,0
chr12 133007917 133007942 Error_Kmer 100 . 133007917 133007942 0,0,0
chr12 133008023 133008052 Error_Kmer 100 . 133008023 133008052 0,0,0
chr12 133008484 133008507 Error_Kmer 100 . 133008484 133008507 0,0,0
chr12 133008908 133008929 Error_Kmer 100 . 133008908 133008929 0,0,0
chr12 133009104 133009125 Error_Kmer 100 . 133009104 133009125 0,0,0
chr12 133009143 133009164 Error_Kmer 100 . 133009143 133009164 0,0,0
chr12 133009278 133009299 Error_Kmer 100 . 133009278 133009299 0,0,0
chr12 133009752 133009773 Error_Kmer 100 . 133009752 133009773 0,0,0
chr12 133009990 133010029 Error_Kmer 100 . 133009990 133010029 0,0,0
chr12 133010075 133010104 Error_Kmer 100 . 133010075 133010104 0,0,0
chr12 133010209 133010237 Error_Kmer 100 . 133010209 133010237 0,0,0
chr12 133010447 133010485 Error_Kmer 100 . 133010447 133010485 0,0,0
chr12 133010718 133010755 Error_Kmer 100 . 133010718 133010755 0,0,0
chr12 133010900 133010921 Error_Kmer 100 . 133010900 133010921 0,0,0
chr12 133011011 133011033 Error_Kmer 100 . 133011011 133011033 0,0,0
chr12 133011087 133011108 Error_Kmer 100 . 133011087 133011108 0,0,0
chr12 133011670 133011695 Error_Kmer 100 . 133011670 133011695 0,0,0
chr13 2279733 2280411 Low 100 . 2279733 2280411 204,0,0
chr13 47349234 47349255 Error_Kmer 100 . 47349234 47349255 0,0,0
chr13 80687867 80687897 Error_Kmer 100 . 80687867 80687897 0,0,0
chr13 113566191 113566227 Error_Kmer 100 . 113566191 113566227 0,0,0
chr14 16833943 16833968 Error_Kmer 100 . 16833943 16833968 0,0,0
chr14 23512862 23512883 Error_Kmer 100 . 23512862 23512883 0,0,0
chr14 26558795 26558825 Error_Kmer 100 . 26558795 26558825 0,0,0
chr14 30764169 30764200 Error_Kmer 100 . 30764169 30764200 0,0,0
chr14 45792849 45792871 Error_Kmer 100 . 45792849 45792871 0,0,0
chr14 61646710 61646733 Error_Kmer 100 . 61646710 61646733 0,0,0
chr14 76805461 76805488 Error_Kmer 100 . 76805461 76805488 0,0,0
chr14 81201274 81201299 Error_Kmer 100 . 81201274 81201299 0,0,0
chr14 82157546 82157576 Error_Kmer 100 . 82157546 82157576 0,0,0
chr15 502271 541273 Low_Qual 100 . 502271 541273 204,0,0
chr15 504736 504773 Error_Kmer 100 . 504736 504773 0,0,0
chr15 505024 505059 Error_Kmer 100 . 505024 505059 0,0,0
chr15 505205 505238 Error_Kmer 100 . 505205 505238 0,0,0
chr15 508826 508850 Error_Kmer 100 . 508826 508850 0,0,0
chr15 521746 521777 Error_Kmer 100 . 521746 521777 0,0,0
chr15 3941213 3941250 Error_Kmer 100 . 3941213 3941250 0,0,0
chr15 17336708 17341835 Low 100 . 17336708 17341835 204,0,0
chr15 24375944 24375972 Error_Kmer 100 . 24375944 24375972 0,0,0
chr15 34984379 34984409 Error_Kmer 100 . 34984379 34984409 0,0,0
chr15 35422413 35422440 Error_Kmer 100 . 35422413 35422440 0,0,0
chr15 50925860 50925888 Error_Kmer 100 . 50925860 50925888 0,0,0
chr15 54393093 54393117 Error_Kmer 100 . 54393093 54393117 0,0,0
chr15 72763972 72764001 Error_Kmer 100 . 72763972 72764001 0,0,0
chr15 74895917 74903394 Low_Qual 100 . 74895917 74903394 204,0,0
chr15 74897483 74897509 Error_Kmer 100 . 74897483 74897509 0,0,0
chr15 79095389 79095419 Error_Kmer 100 . 79095389 79095419 0,0,0
chr15 99750947 99750976 Error_Kmer 100 . 99750947 99750976 0,0,0
chr16 16331572 16338388 Low_Qual 100 . 16331572 16338388 204,0,0
chr16 16331901 16331924 Error_Kmer 100 . 16331901 16331924 0,0,0
chr16 30639378 30651884 Low 100 . 30639378 30651884 204,0,0
chr16 36734605 36774369 Low_Qual 100 . 36734605 36774369 204,0,0
chr16 36754720 36754752 Error_Kmer 100 . 36754720 36754752 0,0,0
chr16 36757195 36757224 Error_Kmer 100 . 36757195 36757224 0,0,0
chr16 84758352 84758381 Error_Kmer 100 . 84758352 84758381 0,0,0
chr16 92408876 92408907 Error_Kmer 100 . 92408876 92408907 0,0,0
chr16 96330293 96330321 Error_Kmer 100 . 96330293 96330321 0,0,0
chr17 14 35 Error_Kmer 100 . 14 35 0,0,0
chr17 1586036 1586061 Error_Kmer 100 . 1586036 1586061 0,0,0
chr17 8544602 8544630 Error_Kmer 100 . 8544602 8544630 0,0,0
chr17 76053796 76053819 Error_Kmer 100 . 76053796 76053819 0,0,0
chr17 84276702 84276724 Error_Kmer 100 . 84276702 84276724 0,0,0
chr17 84276766 84276796 Error_Kmer 100 . 84276766 84276796 0,0,0
chr17 84276869 84276892 Error_Kmer 100 . 84276869 84276892 0,0,0
chr18 135 171 Error_Kmer 100 . 135 171 0,0,0
chr18 4988 5026 Error_Kmer 100 . 4988 5026 0,0,0
chr18 125679 139277 Low_Qual 100 . 125679 139277 204,0,0
chr18 129991 130015 Error_Kmer 100 . 129991 130015 0,0,0
chr18 131558 131582 Error_Kmer 100 . 131558 131582 0,0,0
chr18 132730 132761 Error_Kmer 100 . 132730 132761 0,0,0
chr18 133073 133094 Error_Kmer 100 . 133073 133094 0,0,0
chr18 133419 133479 Error_Kmer 100 . 133419 133479 0,0,0
chr18 178768 205365 Low_Qual 100 . 178768 205365 204,0,0
chr18 183403 183441 Error_Kmer 100 . 183403 183441 0,0,0
chr18 186917 186954 Error_Kmer 100 . 186917 186954 0,0,0
chr18 189629 189651 Error_Kmer 100 . 189629 189651 0,0,0
chr18 196953 196986 Error_Kmer 100 . 196953 196986 0,0,0
chr18 11939068 11939091 Error_Kmer 100 . 11939068 11939091 0,0,0
chr18 25227387 25229168 Low_Qual 100 . 25227387 25229168 204,0,0
chr18 25228465 25228492 Error_Kmer 100 . 25228465 25228492 0,0,0
chr18 26047836 26047862 Error_Kmer 100 . 26047836 26047862 0,0,0
chr18 51275138 51275167 Error_Kmer 100 . 51275138 51275167 0,0,0
chr18 67629207 67629231 Error_Kmer 100 . 67629207 67629231 0,0,0
chr18 73504016 73504042 Error_Kmer 100 . 73504016 73504042 0,0,0
chr19 11 35 Error_Kmer 100 . 11 35 0,0,0
chr19 626 647 Error_Kmer 100 . 626 647 0,0,0
chr19 1178 1201 Error_Kmer 100 . 1178 1201 0,0,0
chr19 1008956 1017105 Low_Qual 100 . 1008956 1017105 204,0,0
chr19 1012265 1012298 Error_Kmer 100 . 1012265 1012298 0,0,0
chr19 1012315 1012348 Error_Kmer 100 . 1012315 1012348 0,0,0
chr19 1012372 1012406 Error_Kmer 100 . 1012372 1012406 0,0,0
chr19 1012525 1012559 Error_Kmer 100 . 1012525 1012559 0,0,0
chr19 1012732 1012755 Error_Kmer 100 . 1012732 1012755 0,0,0
chr19 1012800 1012822 Error_Kmer 100 . 1012800 1012822 0,0,0
chr19 1013530 1013565 Error_Kmer 100 . 1013530 1013565 0,0,0
chr19 1014047 1014080 Error_Kmer 100 . 1014047 1014080 0,0,0
chr19 2347909 2354793 Low_Qual 100 . 2347909 2354793 204,0,0
chr19 2350686 2350724 Error_Kmer 100 . 2350686 2350724 0,0,0
chr19 2351430 2351463 Error_Kmer 100 . 2351430 2351463 0,0,0
chr19 2351530 2351551 Error_Kmer 100 . 2351530 2351551 0,0,0
chr19 2351743 2351765 Error_Kmer 100 . 2351743 2351765 0,0,0
chr19 15433087 15433115 Error_Kmer 100 . 15433087 15433115 0,0,0
chr19 16733142 16733170 Error_Kmer 100 . 16733142 16733170 0,0,0
chr19 24094669 24094695 Error_Kmer 100 . 24094669 24094695 0,0,0
chr19 28509246 28519607 Chimeric_Hap 100 . 28509246 28519607 204,0,0
chr19 28527181 28538920 Chimeric_Hap 100 . 28527181 28538920 204,0,0
chr19 41394406 41394437 Error_Kmer 100 . 41394406 41394437 0,0,0
chr19 42144981 42145162 Low 100 . 42144981 42145162 204,0,0
chr19 56485449 56485477 Error_Kmer 100 . 56485449 56485477 0,0,0
chr19 58806948 58817095 Low_Qual 100 . 58806948 58817095 204,0,0
chr19 58809894 58809921 Error_Kmer 100 . 58809894 58809921 0,0,0
chr19 58810612 58810638 Error_Kmer 100 . 58810612 58810638 0,0,0
chr19 58810655 58810684 Error_Kmer 100 . 58810655 58810684 0,0,0
chr19 58810720 58810753 Error_Kmer 100 . 58810720 58810753 0,0,0
chr19 58810925 58810973 Error_Kmer 100 . 58810925 58810973 0,0,0
chr19 58811064 58811128 Error_Kmer 100 . 58811064 58811128 0,0,0
chr19 58811202 58811230 Error_Kmer 100 . 58811202 58811230 0,0,0
chr19 58811617 58811651 Error_Kmer 100 . 58811617 58811651 0,0,0
chr19 58812342 58812396 Error_Kmer 100 . 58812342 58812396 0,0,0
chr19 58812431 58812452 Error_Kmer 100 . 58812431 58812452 0,0,0
chr19 58812704 58812725 Error_Kmer 100 . 58812704 58812725 0,0,0
chr19 58812734 58812783 Error_Kmer 100 . 58812734 58812783 0,0,0
chr19 58812877 58812903 Error_Kmer 100 . 58812877 58812903 0,0,0
chr19 58812933 58812954 Error_Kmer 100 . 58812933 58812954 0,0,0
chr19 58812982 58813008 Error_Kmer 100 . 58812982 58813008 0,0,0
chr19 58813020 58813081 Error_Kmer 100 . 58813020 58813081 0,0,0
chr19 58813153 58813181 Error_Kmer 100 . 58813153 58813181 0,0,0
chr19 61707119 61707147 Error_Kmer 100 . 61707119 61707147 0,0,0
chr2 32955946 32955976 Error_Kmer 100 . 32955946 32955976 0,0,0
chr2 35847921 35847946 Error_Kmer 100 . 35847921 35847946 0,0,0
chr2 36922400 36922430 Error_Kmer 100 . 36922400 36922430 0,0,0
chr2 67964468 67964494 Error_Kmer 100 . 67964468 67964494 0,0,0
chr2 75124749 75124775 Error_Kmer 100 . 75124749 75124775 0,0,0
chr2 83764062 83764083 Error_Kmer 100 . 83764062 83764083 0,0,0
chr2 88190833 88200026 Low_Qual 100 . 88190833 88200026 204,0,0
chr2 88197111 88197149 Error_Kmer 100 . 88197111 88197149 0,0,0
chr2 92009350 92009379 Error_Kmer 100 . 92009350 92009379 0,0,0
chr2 173553258 173553286 Error_Kmer 100 . 173553258 173553286 0,0,0
chr2 174742805 174742836 Error_Kmer 100 . 174742805 174742836 0,0,0
chr2 234896430 234896457 Error_Kmer 100 . 234896430 234896457 0,0,0
chr2 237006464 237006491 Error_Kmer 100 . 237006464 237006491 0,0,0
chr20 202 253 Error_Kmer 100 . 202 253 0,0,0
chr20 862172 868083 Low_Qual 100 . 862172 868083 204,0,0
chr20 863748 863786 Error_Kmer 100 . 863748 863786 0,0,0
chr20 37336460 37336487 Error_Kmer 100 . 37336460 37336487 0,0,0
chr20 66210164 66210220 Error_Kmer 100 . 66210164 66210220 0,0,0
chr21 0 52 Error_Kmer 100 . 0 52 0,0,0
chr21 42346611 42346632 Error_Kmer 100 . 42346611 42346632 0,0,0
chr22 105 134 Error_Kmer 100 . 105 134 0,0,0
chr22 39107778 39116401 Collapse 100 . 39107778 39116401 204,0,0
chr22 48781817 48781842 Error_Kmer 100 . 48781817 48781842 0,0,0
chr22 51324613 51324650 Error_Kmer 100 . 51324613 51324650 0,0,0
chr22 51324771 51324815 Error_Kmer 100 . 51324771 51324815 0,0,0
chr22 51324823 51324851 Error_Kmer 100 . 51324823 51324851 0,0,0
chr3 1020697 1020721 Error_Kmer 100 . 1020697 1020721 0,0,0
chr3 9173399 9173422 Error_Kmer 100 . 9173399 9173422 0,0,0
chr3 18650709 18650735 Error_Kmer 100 . 18650709 18650735 0,0,0
chr3 19407465 19407495 Error_Kmer 100 . 19407465 19407495 0,0,0
chr3 32904943 32904970 Error_Kmer 100 . 32904943 32904970 0,0,0
chr3 42128159 42128184 Error_Kmer 100 . 42128159 42128184 0,0,0
chr3 124645741 124645769 Error_Kmer 100 . 124645741 124645769 0,0,0
chr3 125750747 125750773 Error_Kmer 100 . 125750747 125750773 0,0,0
chr3 129922396 129922424 Error_Kmer 100 . 129922396 129922424 0,0,0
chr3 140519573 140519598 Error_Kmer 100 . 140519573 140519598 0,0,0
chr3 156625252 156625279 Error_Kmer 100 . 156625252 156625279 0,0,0
chr3 161890449 161890482 Error_Kmer 100 . 161890449 161890482 0,0,0
chr3 167406082 167406109 Error_Kmer 100 . 167406082 167406109 0,0,0
chr3 169182807 169182830 Error_Kmer 100 . 169182807 169182830 0,0,0
chr3 201104796 201104822 Error_Kmer 100 . 201104796 201104822 0,0,0
chr4 57 85 Error_Kmer 100 . 57 85 0,0,0
chr4 7836118 7836171 Error_Kmer 100 . 7836118 7836171 0,0,0
chr4 7837915 7837953 Error_Kmer 100 . 7837915 7837953 0,0,0
chr4 7838395 7838430 Error_Kmer 100 . 7838395 7838430 0,0,0
chr4 7838823 7838846 Error_Kmer 100 . 7838823 7838846 0,0,0
chr4 7839803 7839874 Error_Kmer 100 . 7839803 7839874 0,0,0
chr4 7840155 7840193 Error_Kmer 100 . 7840155 7840193 0,0,0
chr4 21780363 21780388 Error_Kmer 100 . 21780363 21780388 0,0,0
chr4 39783931 39783959 Error_Kmer 100 . 39783931 39783959 0,0,0
chr4 52004666 52039696 Low 100 . 52004666 52039696 204,0,0
chr4 52525146 52534541 Low 100 . 52525146 52534541 204,0,0
chr4 59926407 59926428 Error_Kmer 100 . 59926407 59926428 0,0,0
chr4 96449742 96449767 Error_Kmer 100 . 96449742 96449767 0,0,0
chr4 130120950 130120982 Error_Kmer 100 . 130120950 130120982 0,0,0
chr4 131857243 131857264 Error_Kmer 100 . 131857243 131857264 0,0,0
chr4 144007095 144007121 Error_Kmer 100 . 144007095 144007121 0,0,0
chr4 157555874 157555904 Error_Kmer 100 . 157555874 157555904 0,0,0
chr4 161913286 161913310 Error_Kmer 100 . 161913286 161913310 0,0,0
chr4 169926964 169939706 Low_Qual 100 . 169926964 169939706 204,0,0
chr4 169928017 169928055 Error_Kmer 100 . 169928017 169928055 0,0,0
chr4 186171167 186181524 Low_Qual 100 . 186171167 186181524 204,0,0
chr4 186175475 186175498 Error_Kmer 100 . 186175475 186175498 0,0,0
chr4 186177899 186177920 Error_Kmer 100 . 186177899 186177920 0,0,0
chr5 20 50 Error_Kmer 100 . 20 50 0,0,0
chr5 177 239 Error_Kmer 100 . 177 239 0,0,0
chr5 39409195 39409231 Error_Kmer 100 . 39409195 39409231 0,0,0
chr5 100565817 100565846 Error_Kmer 100 . 100565817 100565846 0,0,0
chr5 102558811 102558836 Error_Kmer 100 . 102558811 102558836 0,0,0
chr5 115533334 115533359 Error_Kmer 100 . 115533334 115533359 0,0,0
chr5 127491575 127491596 Error_Kmer 100 . 127491575 127491596 0,0,0
chr5 156624825 156624848 Error_Kmer 100 . 156624825 156624848 0,0,0
chr5 181651686 181664616 Low_Qual 100 . 181651686 181664616 204,0,0
chr5 181656044 181656078 Error_Kmer 100 . 181656044 181656078 0,0,0
chr5 181658132 181658157 Error_Kmer 100 . 181658132 181658157 0,0,0
chr5 181658357 181658416 Error_Kmer 100 . 181658357 181658416 0,0,0
chr5 181660562 181660583 Error_Kmer 100 . 181660562 181660583 0,0,0
chr5 181660656 181660682 Error_Kmer 100 . 181660656 181660682 0,0,0
chr5 181662240 181662278 Error_Kmer 100 . 181662240 181662278 0,0,0
chr5 181662501 181662539 Error_Kmer 100 . 181662501 181662539 0,0,0
chr5 181662662 181662700 Error_Kmer 100 . 181662662 181662700 0,0,0
chr6 24896924 24896951 Error_Kmer 100 . 24896924 24896951 0,0,0
chr6 40983965 40983995 Error_Kmer 100 . 40983965 40983995 0,0,0
chr6 75720296 75720324 Error_Kmer 100 . 75720296 75720324 0,0,0
chr6 93329327 93329357 Error_Kmer 100 . 93329327 93329357 0,0,0
chr6 118120322 118120344 Error_Kmer 100 . 118120322 118120344 0,0,0
chr6 159016930 159020390 Low_Qual 100 . 159016930 159020390 204,0,0
chr6 159017733 159017754 Error_Kmer 100 . 159017733 159017754 0,0,0
chr6 159019722 159019755 Error_Kmer 100 . 159019722 159019755 0,0,0
chr7 21 65 Error_Kmer 100 . 21 65 0,0,0
chr7 28913046 28913074 Error_Kmer 100 . 28913046 28913074 0,0,0
chr7 35732943 35732973 Error_Kmer 100 . 35732943 35732973 0,0,0
chr7 66195669 66195694 Error_Kmer 100 . 66195669 66195694 0,0,0
chr7 76595745 76614985 Low_Qual 100 . 76595745 76614985 204,0,0
chr7 76597349 76597386 Error_Kmer 100 . 76597349 76597386 0,0,0
chr7 76598439 76598477 Error_Kmer 100 . 76598439 76598477 0,0,0
chr7 76600081 76600102 Error_Kmer 100 . 76600081 76600102 0,0,0
chr7 76600636 76600674 Error_Kmer 100 . 76600636 76600674 0,0,0
chr7 76601635 76601665 Error_Kmer 100 . 76601635 76601665 0,0,0
chr7 76603098 76603137 Error_Kmer 100 . 76603098 76603137 0,0,0
chr7 76606067 76606104 Error_Kmer 100 . 76606067 76606104 0,0,0
chr7 76606197 76606218 Error_Kmer 100 . 76606197 76606218 0,0,0
chr7 76606645 76606684 Error_Kmer 100 . 76606645 76606684 0,0,0
chr7 109039065 109039094 Error_Kmer 100 . 109039065 109039094 0,0,0
chr7 110865328 110865356 Error_Kmer 100 . 110865328 110865356 0,0,0
chr7 119133099 119133128 Error_Kmer 100 . 119133099 119133128 0,0,0
chr7 137214840 137214868 Error_Kmer 100 . 137214840 137214868 0,0,0
chr7 141042665 141042695 Error_Kmer 100 . 141042665 141042695 0,0,0
chr7 146712097 146712127 Error_Kmer 100 . 146712097 146712127 0,0,0
chr7 154391045 154391076 Error_Kmer 100 . 154391045 154391076 0,0,0
chr7 158963005 158967405 Low_Qual 100 . 158963005 158967405 204,0,0
chr7 158965864 158965890 Error_Kmer 100 . 158965864 158965890 0,0,0
chr8 2936792 2936819 Error_Kmer 100 . 2936792 2936819 0,0,0
chr8 17905915 17905936 Error_Kmer 100 . 17905915 17905936 0,0,0
chr8 22670372 22670404 Error_Kmer 100 . 22670372 22670404 0,0,0
chr8 29208097 29208119 Error_Kmer 100 . 29208097 29208119 0,0,0
chr8 33053431 33053461 Error_Kmer 100 . 33053431 33053461 0,0,0
chr8 35495050 35495073 Error_Kmer 100 . 35495050 35495073 0,0,0
chr8 63518391 63518424 Error_Kmer 100 . 63518391 63518424 0,0,0
chr8 89290127 89290150 Error_Kmer 100 . 89290127 89290150 0,0,0
chr8 107000400 107000429 Error_Kmer 100 . 107000400 107000429 0,0,0
chr8 128936552 128936573 Error_Kmer 100 . 128936552 128936573 0,0,0
chr8 142319230 142331423 Low_Qual 100 . 142319230 142331423 204,0,0
chr8 142324441 142324485 Error_Kmer 100 . 142324441 142324485 0,0,0
chr8 143875588 143875616 Error_Kmer 100 . 143875588 143875616 0,0,0
chr9 28418236 28418266 Error_Kmer 100 . 28418236 28418266 0,0,0
chr9 67950189 67954379 Low 100 . 67950189 67954379 204,0,0
chr9 68472007 68472042 Error_Kmer 100 . 68472007 68472042 0,0,0
chr9 68614100 68617917 Low 100 . 68614100 68617917 204,0,0
chr9 78635193 78635222 Error_Kmer 100 . 78635193 78635222 0,0,0
chr9 149602683 149609926 Low_Qual 100 . 149602683 149609926 204,0,0
chr9 149604674 149604695 Error_Kmer 100 . 149604674 149604695 0,0,0
chr9 150616871 150616894 Error_Kmer 100 . 150616871 150616894 0,0,0
chrX 1921076 1933411 Low_Qual 100 . 1921076 1933411 204,0,0
chrX 1929197 1929218 Error_Kmer 100 . 1929197 1929218 0,0,0
chrX 4221750 4221774 Error_Kmer 100 . 4221750 4221774 0,0,0
chrX 7723013 7734574 Low_Qual 100 . 7723013 7734574 204,0,0
chrX 7724146 7724180 Error_Kmer 100 . 7724146 7724180 0,0,0
chrX 7724212 7724239 Error_Kmer 100 . 7724212 7724239 0,0,0
chrX 7724730 7724758 Error_Kmer 100 . 7724730 7724758 0,0,0
chrX 7724831 7724855 Error_Kmer 100 . 7724831 7724855 0,0,0
chrX 7730349 7730374 Error_Kmer 100 . 7730349 7730374 0,0,0
chrX 7730653 7730683 Error_Kmer 100 . 7730653 7730683 0,0,0
chrX 7731981 7732003 Error_Kmer 100 . 7731981 7732003 0,0,0
chrX 7732145 7732166 Error_Kmer 100 . 7732145 7732166 0,0,0
chrX 7732485 7732511 Error_Kmer 100 . 7732485 7732511 0,0,0
chrX 7733174 7733196 Error_Kmer 100 . 7733174 7733196 0,0,0
chrX 7733465 7733487 Error_Kmer 100 . 7733465 7733487 0,0,0
chrX 7734205 7734232 Error_Kmer 100 . 7734205 7734232 0,0,0
chrX 8053742 8053773 Error_Kmer 100 . 8053742 8053773 0,0,0
chrX 8444003 8444031 Error_Kmer 100 . 8444003 8444031 0,0,0
chrX 8656696 8656728 Error_Kmer 100 . 8656696 8656728 0,0,0
chrX 9248146 9248176 Error_Kmer 100 . 9248146 9248176 0,0,0
chrX 16675826 16675848 Error_Kmer 100 . 16675826 16675848 0,0,0
chrX 23408357 23408384 Error_Kmer 100 . 23408357 23408384 0,0,0
chrX 46767602 46767626 Error_Kmer 100 . 46767602 46767626 0,0,0
chrX 56016342 56016375 Error_Kmer 100 . 56016342 56016375 0,0,0
chrX 59219244 59237143 Low 100 . 59219244 59237143 204,0,0
chrX 90397172 90397199 Error_Kmer 100 . 90397172 90397199 0,0,0
chrX 92957972 92958003 Error_Kmer 100 . 92957972 92958003 0,0,0
chrX 123541155 123541182 Error_Kmer 100 . 123541155 123541182 0,0,0
chrX 144228791 144228819 Error_Kmer 100 . 144228791 144228819 0,0,0