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Commit 9b092dc

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Learnr A03La_univariate ready
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DESCRIPTION

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,5 +1,5 @@
11
Package: BioDataScience1
2-
Version: 2023.2.0
2+
Version: 2023.3.0
33
Title: A Series of Learnr Documents for Biological Data Science 1
44
Description: Interactive documents using learnr and shiny applications for studying biological data science.
55
Authors@R: c(

NEWS.md

Lines changed: 4 additions & 0 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,3 +1,7 @@
1+
# BioDataScience1 2023.3.0
2+
3+
- Learnr A03La_univariate ready.
4+
15
# BioDataScience1 2023.2.0
26

37
- Learnrs A02La_base, A02Lb_progression and A02Lc_scatterplot ready.

inst/tutorials/A03La_univariate/A03La_univariate.Rmd.inactive renamed to inst/tutorials/A03La_univariate/A03La_univariate.Rmd

Lines changed: 20 additions & 22 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -38,29 +38,29 @@ BioDataScience1::learnr_server(input, output, session)
3838

3939
- Vérifier l'acquisition des notions relatives aux histogrammes
4040

41-
- Contrôler votre capacité à créer graphiques de densité
41+
- Contrôler votre capacité à créer des graphiques de densité
4242

4343
- Vérifier que vous comprenez et êtes capable de réaliser des diagrammes en violon
4444

4545
## Biométrie humaine
4646

47-
Intéressez vous au jeu de données sur la biométrie humaine ci-dessous.
47+
Intéressez-vous au jeu de données sur la biométrie humaine ci-dessous.
4848

49-
```{r, echo = TRUE}
49+
```{r, echo=TRUE}
5050
# Importation du jeu de données
5151
(biometry <- read("biometry", package = "BioDataScience", lang = "fr"))
5252
```
5353

5454
### Histogramme
5555

56-
Reproduisez le graphique suivant qui représente la distribution de l'age (`age`) des individus sondés lors d'une étude portant sur l'obésité en Hainaut (jeu de données `biometry`. Le genre (`gender`) de ces derniers est employé afin produire deux graphiques. Utilisez l'argument `bins = 30` pour définir le nombre de classe.
56+
Reproduisez le graphique suivant qui représente la distribution de l'âge (`age`) des individus sondés lors d'une étude portant sur l'obésité en Hainaut (jeu de données `biometry`). La variable genre (`gender`) est employée pour séparer en deux graphiques. Utilisez l'argument `bins = 30` pour définir le nombre de classes.
5757

5858
```{r histo_intro}
5959
chart(biometry, ~ age | gender) +
6060
geom_histogram(bins = 30)
6161
```
6262

63-
```{r histo_h3, exercise = TRUE}
63+
```{r histo_h3, exercise=TRUE}
6464
chart(___, ~ ___ ___ ___) +
6565
___(___)
6666
```
@@ -89,14 +89,14 @@ grade_code("Vous venez de réaliser votre premier histogramme !")
8989

9090
### Graphique de densité
9191

92-
Reproduisez le graphique suivant qui représente la répartition de la densité de la hauteur (`height`) en fonction du genre (`gender`) des individus présents dans le jeu de données `biometry`.
92+
Reproduisez le graphique suivant qui représente la densité de répartition de la hauteur (`height`) en fonction du genre (`gender`) des individus présents dans le jeu de données `biometry`.
9393

9494
```{r density_intro}
9595
chart(biometry, ~ height %fill=% gender) +
9696
geom_density()
9797
```
9898

99-
```{r density_h3, exercise = TRUE}
99+
```{r density_h3, exercise=TRUE}
100100
chart(___, ~ ___ ___ ___) +
101101
___()
102102
```
@@ -125,16 +125,14 @@ grade_code("Vous savez maintenant réaliser un graphique de densité.")
125125

126126
### Graphique en violon
127127

128-
Reproduisez le graphique suivant qui représente la répartition de la densité de la hauteur (`height`) en fonction du genre (`gender`) des individus présents dans le jeu de données `biometry`.
129-
130-
**Nom du jeu de données et des variables importantes**
128+
Reproduisez le graphique en violon suivant entre la hauteur (`height`) et le genre (`gender`) des individus présents dans le jeu de données `biometry`.
131129

132130
```{r violin_intro}
133131
chart(biometry, height ~ gender) +
134132
geom_violin()
135133
```
136134

137-
```{r violin_h3, exercise = TRUE}
135+
```{r violin_h3, exercise=TRUE}
138136
chart(___, ___ ~ ___) +
139137
___()
140138
```
@@ -158,14 +156,14 @@ chart(biometry, height ~ gender) +
158156
```
159157

160158
```{r violin_h3-check}
161-
grade_code("Vous maîtrisez un 3^ème^ type de graphique pour représenté la distribution d'une variable numérique. ")
159+
grade_code("Vous maîtrisez un troisième type de graphique pour représenter la distribution d'une variable numérique. ")
162160
```
163161

164162
## Analyse d'image du zooplancton
165163

166-
Intéressez vous au jeu de données sur l'analyse d'image du zooplancton ci-dessous.
164+
Intéressez-vous au jeu de données sur l'analyse d'image du zooplancton ci-dessous.
167165

168-
```{r, echo = TRUE}
166+
```{r, echo=TRUE}
169167
# Importation du jeu de données
170168
(zooplankton <- read("zooplankton", package = "data.io", lang = "fr"))
171169
# Filtre du jeu de données pour obtenir uniquement les copépodes
@@ -183,7 +181,7 @@ chart(copepoda, size ~ class %fill=% class) +
183181
coord_flip()
184182
```
185183

186-
```{r violin2_h3, exercise = TRUE}
184+
```{r violin2_h3, exercise=TRUE}
187185
chart(___, ___ ~ ___ ___ ___) +
188186
geom_violin(show.legend = ___) +
189187
___
@@ -211,7 +209,7 @@ chart(copepoda, size ~ class %fill=% class) +
211209
```
212210

213211
```{r violin2_h3-check}
214-
grade_code("Et une nouvelle fonction de plus pour améliorer la représentation graphique de vos données")
212+
grade_code("Et une nouvelle fonction de plus pour améliorer la représentation graphique de vos données.")
215213
```
216214

217215
### Graphique de densité 1
@@ -223,7 +221,7 @@ chart(copepoda, class ~ size %fill=% class) +
223221
ggridges::geom_density_ridges(show.legend = FALSE)
224222
```
225223

226-
```{r ggridges_h3, exercise = TRUE}
224+
```{r ggridges_h3, exercise=TRUE}
227225
chart(___, ___ ~ ___ ___ ___) +
228226
___(___)
229227
```
@@ -259,7 +257,7 @@ chart(zooplankton, class ~ size) +
259257
ggridges::geom_density_ridges()
260258
```
261259

262-
```{r ggridges2_h2, exercise = TRUE}
260+
```{r ggridges2_h2, exercise=TRUE}
263261
chart(___, ___ ~ ___) +
264262
___()
265263
```
@@ -285,21 +283,21 @@ grade_code("Vous avez certainement compris le principe ici.")
285283

286284
Intéressez vous au jeu de données sur la biométrie d'oursin ci-dessous.
287285

288-
```{r, echo = TRUE}
286+
```{r, echo=TRUE}
289287
# Importation du jeu de données
290288
(urchin <- read("urchin_bio", package = "data.io", lang = "fr"))
291289
```
292290

293291
### Nuage de points 1
294292

295-
À partir du jeu de données `urchin`, reproduisez le graphique suivant qui représente la variation de la taille (`height`) en fonction de la masse (`weight`) des oursins. L'orgine (`origin`) de ces derniers est mis en évidence par la couleur.
293+
À partir du jeu de données `urchin`, reproduisez le graphique suivant qui représente la variation de la taille (`height`) en fonction de la masse (`weight`) des oursins. L'origine (`origin`) de ces derniers est mise en évidence par la couleur.
296294

297295
```{r np_intro}
298296
chart(urchin, height ~ weight %col=% origin) +
299297
geom_point()
300298
```
301299

302-
```{r np_h3, exercise = TRUE}
300+
```{r np_h3, exercise=TRUE}
303301
chart(___, ___ ~ ___ ___ ___) +
304302
___()
305303
```
@@ -335,7 +333,7 @@ chart(urchin, height ~ weight %col=% origin %shape=% sex) +
335333
geom_point()
336334
```
337335

338-
```{r np2_h3, exercise = TRUE}
336+
```{r np2_h3, exercise=TRUE}
339337
# Utiliser la couleur en tant que premier argument et la forme en second
340338
___(___, ___ ~ ___ ___ ___ ___ ___) +
341339
___()

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